Kwa vile sonication inaweza kuharibu protini na denature epitopes za protini, tunatathmini baadaye athari ya sonication kwenye uadilifu wa protini.
Je, sonication inaweza kuharibu protini?
Majibu Maarufu (1)
Itifaki ya kawaida ya sonication badala yake haiwezi kusababisha mgawanyiko wa protini- nishati iko chini sana. Haipaswi hata kusababisha denaturation yake. Inaweza kuwa denaturated wakati sonicate ni muda mrefu sana na overheat sampuli. Ukitumia nikeli chromatrograpy bendi zingine zinaweza kuwa uchafu tu.
Je, sonication inaweza kuvunja bondi za peptidi?
Sonication kwa kawaida haiwezi kuvunja muundo msingi wa kwa sababu muundo huo (mfuatano wa asidi ya amino) umeundwa kwa vifungo vya ushirikiano ambavyo vina nguvu mara nyingi zaidi ya bondi za hidrojeni na sonication. toa nishati inayohitajika kuvunja dhamana hizo.
Je, sonication huvunja utando wa nyuklia?
A sonication fupi yenye nishati kidogo inaweza kuvuruga utando wa plasma bila kuvunja mitochondrial au utando wa nyuklia unaojitoa kwa busara ya mitochondria.
Je, sonication ni muhimu kwa uchimbaji wa protini?
Umumunyisho wa sabuni (k.m., SDS) ambayo inahitajika ili kutenganisha protini za utando husababisha gundi kama lysate kwa sababu ya asidi ya nyukleiki. Kwa hivyo, sonication inahitajika katika hali kama hizi ili kuvuruga asidi hizi za nucleic. Sonication huzalisha joto jingi na haifai kwaprotini nyingi.
