Mbinu zenye msingi wa Chromosome conformation (3C) zinaonyesha mpangilio wa kromosomu ndani ya kiini kwa kubainisha ukaribu halisi wa jozi za pointi pamoja na chromatin. Huhifadhi mwingiliano wa kromatini kwa kuunganisha na kufuatiwa na mgawanyiko, kuunganisha na kupanga sehemu zinazoingiliana.
Je, muundo wa kromosomu hufanya kazi vipi?
Kunasa muundo wa kromosomu kwenye chipu (4C) hunasa mwingiliano kati ya loksi moja na loci nyingine zote za genomic. Inahusisha hatua ya pili ya kuunganisha, kuunda vipande vya DNA vya kujitegemea, vinavyotumiwa kutekeleza PCR kinyume. … Kwenye safu ndogo ndogo, takriban miingiliano milioni moja inaweza kuchanganuliwa.
Unasaji wa muundo wa chromatin ni nini?
Unasaji wa Muundo wa Chromatin (3C) ni mbinu muhimu inayotumiwa kuchunguza muundo wa kromatini, pamoja na msingi wa mbinu zingine kadhaa za derivative. … Itifaki hii inahusisha uunganishaji mtambuka wa formaldehyde wa seli ikifuatiwa na kutengwa kwa kromatini na usagaji chakula kwa kimeng'enya cha kizuizi.
Je, mpangilio wa Hi-C hufanya kazi vipi?
Mbinu ya Hi-C huongeza 3C-Seq ili kuweka anwani za kromatini kwa upana wa genome, na pia imetumika katika kusoma mwingiliano wa kromatini katika situ. Kwa njia hii, tata za DNA-protini zimeunganishwa na formaldehyde. Sampuli imegawanywa, na DNA hutolewa, kuunganishwa, na kuyeyushwa kwa vimeng'enya vyenye vizuizi.
mbinu ya Hi-C ni nini?
Mbinu ya kitamaduni ya Hi-C inahusisha upunguzaji usagaji wa genomu yenye uhusiano mtambuka wa formaldehyde na vimeng'enya vyenye vizuizi vya mfuatano, ikifuatiwa na kujaza na kutengeneza ncha zilizosagwa kwa kujumuisha nucleotidi zilizounganishwa na biotini. Ncha zilizorekebishwa huunganishwa tena.