Kinyume chake, ligasi nyingi za yukariyoti za DNA, pamoja na vimeng'enya vya archaeal na bacteriophage, huanguka katika familia ndogo ya pili; vimeng'enya hivi tumia ATP kama cofactor.
Je, ligasi zinahitaji ATP?
Liga mbili za DNA hutumiwa kwa kawaida. … T4 ligase inahitaji ATP ilhali E. coli ligase inahitaji NAD+ (Nicotinamide adenine dinucleotide ni coenzyme inayojumuisha nt 2 zilizounganishwa kupitia vikundi vyao vya fosfeti.) Zote mbili huchochea kuunganishwa kwa kundi la 5'-phosphate na 3'-OH ili kuunda dhamana ya phosphodiester.
Kwa nini ligasi zinahitaji ATP?
Hatua mbili za mmenyuko wa kuunganisha DNA
Matendo ya kuunganisha DNA yenyewe yana hatua mbili za msingi. Kwanza mwisho wa DNA lazima ugongane kwa bahati na ukae pamoja kwa muda wa kutosha kwa ligase kuungana nao. … Ili kuruhusu kimeng'enya kutekeleza athari zaidi AMP katika tovuti amilifu ya kimeng'enya lazima ijazwe tena na ATP.
Je, ligases hufanya kazi gani?
Ligasi za DNA huwa na jukumu muhimu katika kudumisha uadilifu wa jeni kwa kuunganisha sehemu za uti wa mgongo wa phosphodiester wa DNA unaotokea wakati wa urudufishaji na uchanganyaji, na kama matokeo ya uharibifu wa DNA na ukarabati. Jeni tatu za binadamu, LIG1, LIG3 na LIG4 husimba liga za DNA zinazotegemea ATP.
Ligases zinafanya kazi kwa bidii au kwa utulivu ni nini?
DNA ligase ni inafanya kazi wakati wa urudufishaji, mchakato wa ukarabati na ujumuishaji upya wa DNA. Inatumika sana katika ukarabati wa strand mojahutenganisha DNA yenye uwili wa viumbe hai kwa kutumia uzi unaosaidia wa helix mbili kama kiolezo, ilhali baadhi ya miundo inaweza kurekebisha uharibifu wa nyuzi mbili mahususi.