Wakati wa kutumia homolojia?

Orodha ya maudhui:

Wakati wa kutumia homolojia?
Wakati wa kutumia homolojia?
Anonim

Miundo ya Homolojia pia inaweza kutumika kubainisha tofauti ndogo ndogo kati ya protini zinazohusiana ambazo hazijatatuliwa zote kimuundo . Kwa mfano, mbinu ilitumika kutambua tovuti zinazofunga mawasiliano kwenye Na+/K+ ATPase na kupendekeza dhana dhahania kuhusu mshikamano tofauti wa ATPases..

Miundo ya homolojia inatumika kwa nini?

Muundo wa Homolojia ni mojawapo ya mbinu za utabiri wa muundo wa kimahesabu ambazo hutumika kubainisha muundo wa 3D wa protini kutoka kwa mfuatano wake wa asidi ya amino. Inachukuliwa kuwa sahihi zaidi ya mbinu za utabiri wa muundo wa hesabu. Inajumuisha hatua nyingi ambazo ni moja kwa moja na rahisi kutumia.

Muundo wa homolojia ni nini na kwa nini unahitajika?

Muundo wa Homolojia hupata muundo wa miraba mitatu ya protini lengwa kulingana na ufanano kati ya kiolezo na mfuatano lengwa na mbinu hii inathibitisha kuwa ya ufanisi linapokuja suala la kusoma protini za utando ambazo ni ngumu kuangaza kama GPCR kwani hutoa kiwango cha juu cha uelewa wa …

Je, unafanyaje modeli ya homolojia?

kuna hatua kadhaa zinazohusika katika uundaji wa homolojia

  1. uteuzi wa kiolezo kwa kutumia mfuatano unaolengwa. Kwa kusudi hili unaweza kufanya utafutaji wa BLASTp dhidi ya miundo yote ya protini inayopatikana (PDBs). …
  2. Mpangilio wa kiolezo na mlolongo lengwa. …
  3. Ubora wa muundo wako. …
  4. Uboreshajiya mtindo wako ipasavyo.

Ni nini hufanya Muundo mzuri wa homolojia?

Tukifafanua "muundo wa homolojia uliofanikiwa sana" kama ule ulio na <=2 Å rmsd kutoka kwa muundo wa majaribio, basi kiolezo lazima kiwe na >=60% ya utambulisho wa mfuatano kwa lengo la mafanikio. kiwango >70%. Hata katika utambulisho wa mfuatano wa juu (60% -95%), kama modeli moja kati ya kumi ya homolojia ina rmsd >5 Å vs.

Ilipendekeza:

Makala ya kuvutia
Je, tunaruhusu utata katika injini tafuti?
Soma zaidi

Je, tunaruhusu utata katika injini tafuti?

Inaaminika kote kuwa hoja nyingi zinazowasilishwa kwa injini za utafutaji zina utata asili (k.m., java na apple). … Tatu, tunapendekeza mbinu ya kujifunza inayosimamiwa ili kutambua maswali tata kiotomatiki. Matokeo ya majaribio yanaonyesha kuwa tunaweza kutambua kwa usahihi 87% ya hoja zilizo na lebo kwa mbinu hii.

Je, marafiki walihamasishwa na taya?
Soma zaidi

Je, marafiki walihamasishwa na taya?

Jeneza na Renaud pia waliongoza muundo wa wahusika wa Minions, na huenda walihamasishwa na Jawas katika Star Wars au Oompa Loompas katika Willy Wonka & Kiwanda cha Chokoleti. Lugha ya marafiki inatokana na nini? Lugha ya marafiki ni pamoja na Kifaransa, Kihispania … na marejeleo ya vyakula.

Je, Verre ni wa kiume au wa kike?
Soma zaidi

Je, Verre ni wa kiume au wa kike?

"Un verre" ni kiume, kama nomino nyingine nyingi zinazoishia na -e. Je, si kweli au si kweli? Kwa kuwa wote wawili wanamaanisha kinywaji, kuna tofauti gani? Ninajua kuwa un verre ni glasi, na une boisson ni kinywaji/kinywaji.