Proline mara nyingi hupatikana mwishoni mwa α helix au kwa zamu au mizunguko. Tofauti na asidi nyingine za amino ambazo zipo karibu pekee katika mabadiliko katika polipeptidi, proline inaweza kuwepo katika usanidi wa cis katika peptidi.
Je, helikopta za alpha zina mabaki ya proline?
Kwa kuwa sasa kuna miundo zaidi ya 30,000 ya protini katika Benki ya Data ya Protini, ni wazi kuwa mabaki ya proline yapo kwenye α-heli, ambapo mara nyingi hutekeleza majukumu muhimu. katika muundo na utendaji kazi wa protini.
Amino asidi zipi ziko kwenye heli za alpha?
Amino asidi yoyote kati ya 20 inaweza kushiriki katika α-helix lakini baadhi hupendelewa zaidi kuliko nyingine. Ala, Glu, Leu, na Met mara nyingi hupatikana kwenye helis ilhali Gly, Tyr, Ser, na Pro zina uwezekano mdogo wa kuonekana.
Je, laha za beta zina proline?
Proline haipendelewi katika miundo ya laha ya beta kwa kuwa haiwezi kukamilisha mtandao wa H-bonding. Proline inapotokea kwenye laha, inaweza kuwa katika ukingo au ukingo wa laha ambapo ukosefu wa kipengee cha dhamana ya amino hidrojeni si muhimu.
Ni nini kina herufi za alpha?
Alpha helix (α-helix) ni motifu ya kawaida katika muundo wa pili wa protini na ni muundo wa mkono wa kulia ambapo kila uti wa mgongo N−H kundi la hidrojeni. vifungo kwa uti wa mgongo C=O. kundi la asidi ya amino lililopatikana mabaki manne mapema kwenye mfuatano wa protini.
